У меня Ford Focus ZX3, но только 2002 года. Эксплуатирую с 2009 года. Разница только в движках-у меня Zetec-E, у вас Duratec, но принцип тот же. Если в движении коробка не дёргается и не пинается переключается на все передачи, то с коробкой всё в порядке. Наши коробки очень живучи в этом плане, не то что нынешние.Если слабые толчки на месте, то это тоже в норме, а вот если сильные, то это причина в опорах двигателя. Проверьте все три опоры. Одна убитая опора влечёт последствия всех остальных. Часто из строя выходит нижняя опора АКПП. Сам мучился с этим вопросом, пока не поменял на оригинал. Ставил аналоги-одна проходила три месяца, другая год.
Так же была и течь из под клапанной крышки-это фордовская болезнь. Чуть перельёшь среднее значение уровня меток щупа-всё, течь обеспечена. Повторная установка прокладки кл.кр. не желательна, т.к. она уже будет деформирована. Многое зависит от правильности установки прокладки и кл. крышки. Обязательно нужно прочистить
от масла посадочные места, как в крышке, так и на головке двигателя. И затягивать болты нужно все равномерно, чтобы крышка встала без перекосов.
https://www.youtube.com/watch?v=RObh9cxWF3w&list=PL8MM_8HNc-R62z4Y2jdgqqUxBCKYU28v0&index=45&t=0s
Цепь ГРМ-менять однозначно и не затягивать.